呼瑪縣內(nèi)大小河流39條，水面面積28.11萬畝，被伊勒呼里山切割成南北兩大水系。南坡流域?yàn)槟劢担饕Я饔卸樱吕拥龋槐逼铝饔驗(yàn)楹邶埥担饕Я饔泻衄敽印捄拥取＿吘澈恿骱邶埥鹘?jīng)境內(nèi)長度377.5公里，流域面積12.73平方公里；呼瑪河流經(jīng)境內(nèi)長度209.6公里，在呼瑪縣境內(nèi)匯入黑龍江；嫩江及其源頭之一的二根河是呼瑪縣與內(nèi)蒙鄂倫春自治旗的一段界江，嫩江在縣境內(nèi)江段75.6公里，流域面積1605平方公里。

全縣有自然泡沼331個(gè)，水面6899畝，江河泡水面總面積占全縣面積的1.3%。

全縣人均水量10.4萬立米，高于全省和全國水平。水資源總量為37.5億立方米（過境水量未計(jì)）。初步查明可開發(fā)的水能資源的裝機(jī)容量近50萬千瓦（不包括黑龍江）。目前，已經(jīng)開發(fā)利用的有三卡鄉(xiāng)境內(nèi)寬河上游的全國最北水電站桃源峰水電站，庫容1.05億立方米，裝機(jī)容量10.5MW，占總開發(fā)量的0.26%。